Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
TOP2BQ02880 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC38.2■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TOP2BQ02880 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162 ms