Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NHLH1Q02575 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms