Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms