Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSC2Q02487 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms