Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1DQ01668 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms