Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLTCQ00610 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLTCQ00610 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms