Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2C1P98194 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms