Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms