Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms