Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HPCAP84074 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPCAP84074 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPCAP84074 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPCAP84074 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPCAP84074 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPCAP84074 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPCAP84074 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPCAP84074 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPCAP84074 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HPCAP84074 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPCAP84074 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPCAP84074 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPCAP84074 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPCAP84074 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HPCAP84074 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPCAP84074 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPCAP84074 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPCAP84074 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPCAP84074 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPCAP84074 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPCAP84074 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPCAP84074 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPCAP84074 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPCAP84074 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPCAP84074 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPCAP84074 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPCAP84074 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HPCAP84074 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPCAP84074 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPCAP84074 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPCAP84074 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPCAP84074 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPCAP84074 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPCAP84074 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPCAP84074 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPCAP84074 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPCAP84074 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPCAP84074 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HPCAP84074 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPCAP84074 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPCAP84074 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPCAP84074 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPCAP84074 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPCAP84074 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPCAP84074 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPCAP84074 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPCAP84074 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPCAP84074 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPCAP84074 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPCAP84074 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPCAP84074 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPCAP84074 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPCAP84074 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPCAP84074 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPCAP84074 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPCAP84074 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPCAP84074 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPCAP84074 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPCAP84074 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HPCAP84074 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPCAP84074 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPCAP84074 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPCAP84074 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPCAP84074 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPCAP84074 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPCAP84074 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPCAP84074 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPCAP84074 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPCAP84074 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HPCAP84074 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPCAP84074 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPCAP84074 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPCAP84074 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HPCAP84074 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPCAP84074 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPCAP84074 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPCAP84074 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPCAP84074 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPCAP84074 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HPCAP84074 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPCAP84074 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HPCAP84074 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPCAP84074 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPCAP84074 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPCAP84074 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPCAP84074 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPCAP84074 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPCAP84074 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPCAP84074 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPCAP84074 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPCAP84074 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPCAP84074 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPCAP84074 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HPCAP84074 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HPCAP84074 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAP84074 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAP84074 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAP84074 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAP84074 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms