Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms