Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKP1P63208 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKP1P63208 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKP1P63208 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SKP1P63208 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKP1P63208 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKP1P63208 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKP1P63208 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKP1P63208 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKP1P63208 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKP1P63208 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKP1P63208 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKP1P63208 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKP1P63208 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKP1P63208 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKP1P63208 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKP1P63208 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKP1P63208 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKP1P63208 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKP1P63208 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKP1P63208 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKP1P63208 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SKP1P63208 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKP1P63208 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SKP1P63208 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKP1P63208 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKP1P63208 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKP1P63208 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKP1P63208 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKP1P63208 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKP1P63208 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKP1P63208 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKP1P63208 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKP1P63208 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKP1P63208 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SKP1P63208 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKP1P63208 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKP1P63208 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKP1P63208 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKP1P63208 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKP1P63208 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKP1P63208 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKP1P63208 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKP1P63208 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SKP1P63208 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKP1P63208 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKP1P63208 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SKP1P63208 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKP1P63208 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKP1P63208 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKP1P63208 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKP1P63208 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKP1P63208 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKP1P63208 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKP1P63208 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKP1P63208 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP1P63208 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP1P63208 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP1P63208 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP1P63208 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP1P63208 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP1P63208 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP1P63208 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP1P63208 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP1P63208 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP1P63208 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP1P63208 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP1P63208 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP1P63208 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP1P63208 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKP1P63208 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKP1P63208 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKP1P63208 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKP1P63208 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKP1P63208 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKP1P63208 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKP1P63208 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKP1P63208 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKP1P63208 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKP1P63208 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKP1P63208 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKP1P63208 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKP1P63208 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP1P63208 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP1P63208 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP1P63208 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP1P63208 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP1P63208 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP1P63208 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP1P63208 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP1P63208 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP1P63208 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP1P63208 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP1P63208 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP1P63208 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKP1P63208 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SKP1P63208 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKP1P63208 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKP1P63208 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKP1P63208 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms