Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms