Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPD3P62318 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPD3P62318 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNRPD3P62318 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPD3P62318 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms