Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2BFSP57053 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms