Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX17P56962 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX17P56962 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX17P56962 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX17P56962 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX17P56962 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX17P56962 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX17P56962 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX17P56962 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX17P56962 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX17P56962 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX17P56962 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX17P56962 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX17P56962 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX17P56962 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX17P56962 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX17P56962 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX17P56962 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX17P56962 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX17P56962 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX17P56962 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX17P56962 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX17P56962 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX17P56962 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX17P56962 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX17P56962 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
STX17P56962 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX17P56962 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX17P56962 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX17P56962 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
STX17P56962 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX17P56962 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX17P56962 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX17P56962 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX17P56962 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX17P56962 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX17P56962 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX17P56962 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX17P56962 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX17P56962 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX17P56962 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX17P56962 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX17P56962 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX17P56962 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX17P56962 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX17P56962 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX17P56962 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX17P56962 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
STX17P56962 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX17P56962 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX17P56962 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STX17P56962 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STX17P56962 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STX17P56962 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STX17P56962 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STX17P56962 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STX17P56962 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STX17P56962 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STX17P56962 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STX17P56962 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STX17P56962 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
STX17P56962 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STX17P56962 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STX17P56962 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STX17P56962 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STX17P56962 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
STX17P56962 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STX17P56962 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STX17P56962 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STX17P56962 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STX17P56962 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STX17P56962 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STX17P56962 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STX17P56962 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STX17P56962 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STX17P56962 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
STX17P56962 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STX17P56962 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STX17P56962 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STX17P56962 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STX17P56962 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STX17P56962 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
STX17P56962 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STX17P56962 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STX17P56962 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX17P56962 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX17P56962 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX17P56962 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX17P56962 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX17P56962 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX17P56962 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
STX17P56962 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX17P56962 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX17P56962 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX17P56962 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX17P56962 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX17P56962 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
STX17P56962 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX17P56962 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
STX17P56962 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms