Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN17P56750 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLDN17P56750 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms