Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AFDNP55196 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
AFDNP55196 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
AFDNP55196 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
AFDNP55196 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AFDNP55196 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
AFDNP55196 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
AFDNP55196 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
AFDNP55196 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
AFDNP55196 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
AFDNP55196 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AFDNP55196 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AFDNP55196 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AFDNP55196 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AFDNP55196 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AFDNP55196 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AFDNP55196 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AFDNP55196 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AFDNP55196 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AFDNP55196 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AFDNP55196 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AFDNP55196 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AFDNP55196 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AFDNP55196 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AFDNP55196 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AFDNP55196 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AFDNP55196 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AFDNP55196 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AFDNP55196 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AFDNP55196 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AFDNP55196 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AFDNP55196 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AFDNP55196 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AFDNP55196 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
AFDNP55196 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AFDNP55196 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AFDNP55196 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AFDNP55196 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
AFDNP55196 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AFDNP55196 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AFDNP55196 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AFDNP55196 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AFDNP55196 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AFDNP55196 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AFDNP55196 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AFDNP55196 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AFDNP55196 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
AFDNP55196 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AFDNP55196 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
AFDNP55196 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
AFDNP55196 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
AFDNP55196 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
AFDNP55196 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
AFDNP55196 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
AFDNP55196 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AFDNP55196 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
AFDNP55196 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
AFDNP55196 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
AFDNP55196 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
AFDNP55196 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
AFDNP55196 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
AFDNP55196 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
AFDNP55196 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AFDNP55196 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
AFDNP55196 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
AFDNP55196 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
AFDNP55196 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AFDNP55196 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AFDNP55196 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AFDNP55196 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
AFDNP55196 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AFDNP55196 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AFDNP55196 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AFDNP55196 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AFDNP55196 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AFDNP55196 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AFDNP55196 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AFDNP55196 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AFDNP55196 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AFDNP55196 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AFDNP55196 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AFDNP55196 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AFDNP55196 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AFDNP55196 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AFDNP55196 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AFDNP55196 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AFDNP55196 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AFDNP55196 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AFDNP55196 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AFDNP55196 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AFDNP55196 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AFDNP55196 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
AFDNP55196 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AFDNP55196 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AFDNP55196 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AFDNP55196 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AFDNP55196 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AFDNP55196 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AFDNP55196 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AFDNP55196 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms