Protein–RNA interactions for Protein: P55056

APOC4, Apolipoprotein C-IV, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4P55056 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4P55056 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4P55056 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4P55056 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4P55056 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4P55056 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4P55056 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4P55056 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4P55056 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4P55056 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4P55056 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4P55056 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4P55056 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4P55056 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4P55056 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4P55056 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4P55056 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4P55056 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4P55056 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4P55056 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4P55056 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4P55056 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4P55056 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4P55056 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4P55056 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4P55056 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4P55056 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4P55056 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4P55056 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4P55056 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4P55056 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4P55056 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4P55056 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4P55056 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4P55056 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4P55056 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4P55056 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4P55056 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4P55056 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4P55056 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4P55056 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4P55056 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4P55056 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4P55056 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4P55056 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4P55056 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4P55056 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4P55056 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4P55056 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4P55056 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4P55056 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4P55056 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4P55056 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4P55056 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4P55056 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4P55056 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4P55056 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4P55056 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4P55056 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4P55056 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4P55056 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4P55056 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4P55056 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4P55056 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4P55056 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4P55056 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4P55056 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4P55056 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4P55056 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4P55056 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4P55056 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4P55056 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4P55056 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4P55056 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4P55056 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4P55056 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC4P55056 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC4P55056 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4P55056 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4P55056 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4P55056 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4P55056 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4P55056 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4P55056 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4P55056 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4P55056 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4P55056 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4P55056 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4P55056 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4P55056 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4P55056 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4P55056 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4P55056 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4P55056 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4P55056 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4P55056 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4P55056 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4P55056 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4P55056 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4P55056 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 769.2 ms