Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 GPI18YBR004C 1302 nt5.38□□□□□ -1.55
HEF3P53978 FLO8YER109C 2400 nt5.38□□□□□ -1.55
HEF3P53978 RAD53YPL153C 2466 nt5.38□□□□□ -1.55
HEF3P53978 CYK3YDL117W 2658 nt5.37□□□□□ -1.55
HEF3P53978 PHM8YER037W 966 nt5.37□□□□□ -1.55
HEF3P53978 YLR407WYLR407W 687 nt5.37□□□□□ -1.55
HEF3P53978 HEM15YOR176W 1182 nt5.37□□□□□ -1.55
HEF3P53978 SUA7YPR086W 1038 nt5.37□□□□□ -1.55
HEF3P53978 GCR1YPL075W 2358 nt5.37□□□□□ -1.55
HEF3P53978 CLF1YLR117C 2064 nt5.36□□□□□ -1.55
HEF3P53978 THS1YIL078W 2205 nt5.36□□□□□ -1.55
HEF3P53978 TAF10YDR167W 621 nt5.36□□□□□ -1.55
HEF3P53978 KRE9YJL174W 831 nt5.36□□□□□ -1.55
HEF3P53978 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.36□□□□□ -1.55
HEF3P53978 RAD52YML032C 1416 nt5.36□□□□□ -1.55
HEF3P53978 WHI4YDL224C 1950 nt5.36□□□□□ -1.55
HEF3P53978 PRD1YCL057W 2139 nt5.36□□□□□ -1.55
HEF3P53978 HIS4YCL030C 2400 nt5.36□□□□□ -1.55
HEF3P53978 SUL2YLR092W 2682 nt5.36□□□□□ -1.55
HEF3P53978 YPS7YDR349C 1791 nt5.35□□□□□ -1.55
HEF3P53978 RAD57YDR004W 1383 nt5.35□□□□□ -1.55
HEF3P53978 YDR056CYDR056C 618 nt5.35□□□□□ -1.55
HEF3P53978 BUD13YGL174W 801 nt5.35□□□□□ -1.55
HEF3P53978 EXO1YOR033C 2109 nt5.35□□□□□ -1.55
HEF3P53978 YOL075CYOL075C 3885 nt5.34□□□□□ -1.55
HEF3P53978 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt5.34□□□□□ -1.55
HEF3P53978 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt5.34□□□□□ -1.55
HEF3P53978 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt5.34□□□□□ -1.55
HEF3P53978 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt5.34□□□□□ -1.55
HEF3P53978 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt5.34□□□□□ -1.55
HEF3P53978 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt5.34□□□□□ -1.55
HEF3P53978 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt5.34□□□□□ -1.55
HEF3P53978 YIR043CYIR043C 693 nt5.34□□□□□ -1.55
HEF3P53978 YKL107WYKL107W 930 nt5.34□□□□□ -1.55
HEF3P53978 YBL010CYBL010C 843 nt5.34□□□□□ -1.55
HEF3P53978 VAN1YML115C 1608 nt5.34□□□□□ -1.56
HEF3P53978 ARN1YHL040C 1884 nt5.33□□□□□ -1.56
HEF3P53978 TRM11YOL124C 1302 nt5.33□□□□□ -1.56
HEF3P53978 YCR006CYCR006C 474 nt5.33□□□□□ -1.56
HEF3P53978 SRG1SRG1 551 nt5.33□□□□□ -1.56
HEF3P53978 CDC42YLR229C 576 nt5.33□□□□□ -1.56
HEF3P53978 NRM1YNR009W 750 nt5.33□□□□□ -1.56
HEF3P53978 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.32□□□□□ -1.56
HEF3P53978 MATALPHA1YCR040W 528 nt5.32□□□□□ -1.56
HEF3P53978 RTT103YDR289C 1230 nt5.32□□□□□ -1.56
HEF3P53978 PDE1YGL248W 1110 nt5.32□□□□□ -1.56
HEF3P53978 RRT7YLL030C 342 nt5.32□□□□□ -1.56
HEF3P53978 ENV9YOR246C 993 nt5.32□□□□□ -1.56
HEF3P53978 ECM33YBR078W 1290 nt5.32□□□□□ -1.56
HEF3P53978 PMT2YAL023C 2280 nt5.32□□□□□ -1.56
HEF3P53978 KAP114YGL241W 3015 nt5.31□□□□□ -1.56
HEF3P53978 FRT2YAL028W 1587 nt5.31□□□□□ -1.56
HEF3P53978 AIM7YDR063W 450 nt5.31□□□□□ -1.56
HEF3P53978 MMS21YEL019C 804 nt5.31□□□□□ -1.56
HEF3P53978 RPL12AYEL054C 498 nt5.31□□□□□ -1.56
HEF3P53978 PXR1YGR280C 816 nt5.31□□□□□ -1.56
HEF3P53978 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt5.31□□□□□ -1.56
HEF3P53978 RAD27YKL113C 1149 nt5.31□□□□□ -1.56
HEF3P53978 YAR030CYAR030C 342 nt5.31□□□□□ -1.56
HEF3P53978 YAR061WYAR061W 204 nt5.31□□□□□ -1.56
HEF3P53978 SEC72YLR292C 582 nt5.31□□□□□ -1.56
HEF3P53978 PDR16YNL231C 1056 nt5.31□□□□□ -1.56
HEF3P53978 TIP41YPR040W 1071 nt5.31□□□□□ -1.56
HEF3P53978 BUD25YER014C-A 462 nt5.3□□□□□ -1.56
HEF3P53978 SCP1YOR367W 603 nt5.3□□□□□ -1.56
HEF3P53978 FAR10YLR238W 1437 nt5.3□□□□□ -1.56
HEF3P53978 YLH47YPR125W 1365 nt5.29□□□□□ -1.56
HEF3P53978 NPY1YGL067W 1155 nt5.29□□□□□ -1.56
HEF3P53978 YCR023CYCR023C 1836 nt5.29□□□□□ -1.56
HEF3P53978 HOYDL227C 1761 nt5.29□□□□□ -1.56
HEF3P53978 ARH1YDR376W 1482 nt5.28□□□□□ -1.56
HEF3P53978 UPS3YDR185C 540 nt5.28□□□□□ -1.56
HEF3P53978 CNB1YKL190W 528 nt5.28□□□□□ -1.56
HEF3P53978 TMA17YDL110C 453 nt5.27□□□□□ -1.57
HEF3P53978 NUP42YDR192C 1293 nt5.27□□□□□ -1.57
HEF3P53978 KRE28YDR532C 1158 nt5.27□□□□□ -1.57
HEF3P53978 BNA6YFR047C 888 nt5.27□□□□□ -1.57
HEF3P53978 EFB1YAL003W 621 nt5.27□□□□□ -1.57
HEF3P53978 SPC42YKL042W 1092 nt5.27□□□□□ -1.57
HEF3P53978 RDN5-1RDN5-1 121 nt5.27□□□□□ -1.57
HEF3P53978 PML1YLR016C 615 nt5.27□□□□□ -1.57
HEF3P53978 RDN5-6RDN5-6 121 nt5.27□□□□□ -1.57
HEF3P53978 MUM3YOR298W 1440 nt5.27□□□□□ -1.57
HEF3P53978 PEX30YLR324W 1572 nt5.26□□□□□ -1.57
HEF3P53978 RPC53YDL150W 1269 nt5.26□□□□□ -1.57
HEF3P53978 CSR1YLR380W 1227 nt5.26□□□□□ -1.57
HEF3P53978 MTF1YMR228W 1026 nt5.26□□□□□ -1.57
HEF3P53978 SPN1YPR133C 1233 nt5.26□□□□□ -1.57
HEF3P53978 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt5.26□□□□□ -1.57
HEF3P53978 MMR1YLR190W 1476 nt5.26□□□□□ -1.57
HEF3P53978 RXT3YDL076C 885 nt5.25□□□□□ -1.57
HEF3P53978 RAM1YDL090C 1296 nt5.25□□□□□ -1.57
HEF3P53978 SPO12YHR152W 522 nt5.25□□□□□ -1.57
HEF3P53978 MNN11YJL183W 1269 nt5.25□□□□□ -1.57
HEF3P53978 YML031C-AYML031C-A 336 nt5.25□□□□□ -1.57
HEF3P53978 CKA2YOR061W 1020 nt5.25□□□□□ -1.57
HEF3P53978 YOR131CYOR131C 657 nt5.25□□□□□ -1.57
HEF3P53978 POP4YBR257W 840 nt5.25□□□□□ -1.57
HEF3P53978 DNF2YDR093W 4839 nt5.25□□□□□ -1.57
HEF3P53978 MSK1YNL073W 1731 nt5.25□□□□□ -1.57
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