Protein–RNA interactions for Protein: P53701

HCCS, Cytochrome c-type heme lyase, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCCSP53701 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCCSP53701 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCCSP53701 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HCCSP53701 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCCSP53701 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCCSP53701 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCCSP53701 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCCSP53701 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCCSP53701 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCCSP53701 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCCSP53701 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCCSP53701 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCCSP53701 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCCSP53701 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCCSP53701 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCCSP53701 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCCSP53701 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCCSP53701 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCCSP53701 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCCSP53701 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCCSP53701 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HCCSP53701 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCCSP53701 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCCSP53701 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCCSP53701 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HCCSP53701 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HCCSP53701 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HCCSP53701 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HCCSP53701 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HCCSP53701 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HCCSP53701 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HCCSP53701 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HCCSP53701 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HCCSP53701 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HCCSP53701 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCCSP53701 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCCSP53701 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCCSP53701 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCCSP53701 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCCSP53701 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCCSP53701 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCCSP53701 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCCSP53701 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCCSP53701 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCCSP53701 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HCCSP53701 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCCSP53701 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCCSP53701 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCCSP53701 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCCSP53701 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCCSP53701 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCCSP53701 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCCSP53701 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCCSP53701 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCCSP53701 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCCSP53701 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCCSP53701 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCCSP53701 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCCSP53701 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCCSP53701 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCCSP53701 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCCSP53701 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCCSP53701 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCCSP53701 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCCSP53701 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCCSP53701 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCCSP53701 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCCSP53701 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCCSP53701 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCCSP53701 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCCSP53701 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCCSP53701 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCCSP53701 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCCSP53701 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCCSP53701 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HCCSP53701 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCCSP53701 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCCSP53701 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCCSP53701 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCCSP53701 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCCSP53701 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCCSP53701 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCCSP53701 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCCSP53701 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCCSP53701 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCCSP53701 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCCSP53701 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCCSP53701 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCCSP53701 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCCSP53701 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCCSP53701 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCCSP53701 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCCSP53701 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCCSP53701 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCCSP53701 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HCCSP53701 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HCCSP53701 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HCCSP53701 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HCCSP53701 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HCCSP53701 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms