Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP1P50238 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.9 ms