Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NUP153P49790 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NUP153P49790 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NUP153P49790 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NUP153P49790 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NUP153P49790 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NUP153P49790 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NUP153P49790 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
NUP153P49790 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NUP153P49790 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NUP153P49790 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NUP153P49790 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NUP153P49790 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NUP153P49790 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NUP153P49790 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NUP153P49790 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
NUP153P49790 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NUP153P49790 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NUP153P49790 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NUP153P49790 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NUP153P49790 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NUP153P49790 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NUP153P49790 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
NUP153P49790 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NUP153P49790 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
NUP153P49790 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NUP153P49790 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NUP153P49790 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NUP153P49790 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
NUP153P49790 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NUP153P49790 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NUP153P49790 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NUP153P49790 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NUP153P49790 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
NUP153P49790 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NUP153P49790 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NUP153P49790 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NUP153P49790 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NUP153P49790 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NUP153P49790 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NUP153P49790 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NUP153P49790 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NUP153P49790 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NUP153P49790 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NUP153P49790 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
NUP153P49790 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NUP153P49790 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NUP153P49790 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NUP153P49790 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NUP153P49790 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NUP153P49790 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NUP153P49790 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NUP153P49790 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NUP153P49790 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NUP153P49790 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NUP153P49790 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NUP153P49790 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NUP153P49790 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NUP153P49790 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NUP153P49790 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
NUP153P49790 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
NUP153P49790 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
NUP153P49790 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
NUP153P49790 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NUP153P49790 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NUP153P49790 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NUP153P49790 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NUP153P49790 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NUP153P49790 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
NUP153P49790 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NUP153P49790 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NUP153P49790 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NUP153P49790 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NUP153P49790 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NUP153P49790 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NUP153P49790 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NUP153P49790 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NUP153P49790 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NUP153P49790 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NUP153P49790 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NUP153P49790 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NUP153P49790 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NUP153P49790 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NUP153P49790 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NUP153P49790 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NUP153P49790 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NUP153P49790 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NUP153P49790 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NUP153P49790 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NUP153P49790 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NUP153P49790 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NUP153P49790 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
NUP153P49790 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NUP153P49790 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NUP153P49790 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NUP153P49790 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NUP153P49790 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NUP153P49790 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NUP153P49790 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
NUP153P49790 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms