Protein–RNA interactions for Protein: P49754

VPS41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS41P49754 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS41P49754 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS41P49754 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS41P49754 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS41P49754 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS41P49754 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS41P49754 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS41P49754 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS41P49754 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS41P49754 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS41P49754 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS41P49754 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS41P49754 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS41P49754 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS41P49754 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS41P49754 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS41P49754 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS41P49754 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS41P49754 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS41P49754 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS41P49754 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS41P49754 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS41P49754 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS41P49754 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS41P49754 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS41P49754 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS41P49754 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS41P49754 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS41P49754 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS41P49754 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS41P49754 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS41P49754 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS41P49754 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS41P49754 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS41P49754 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS41P49754 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS41P49754 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS41P49754 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS41P49754 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS41P49754 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS41P49754 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS41P49754 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS41P49754 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS41P49754 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS41P49754 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS41P49754 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS41P49754 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS41P49754 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS41P49754 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS41P49754 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS41P49754 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS41P49754 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS41P49754 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS41P49754 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS41P49754 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS41P49754 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS41P49754 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS41P49754 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS41P49754 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS41P49754 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS41P49754 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS41P49754 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS41P49754 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS41P49754 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS41P49754 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS41P49754 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS41P49754 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS41P49754 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS41P49754 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS41P49754 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS41P49754 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS41P49754 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS41P49754 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS41P49754 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS41P49754 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS41P49754 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS41P49754 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS41P49754 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS41P49754 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS41P49754 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS41P49754 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS41P49754 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS41P49754 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS41P49754 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS41P49754 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS41P49754 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS41P49754 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS41P49754 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS41P49754 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS41P49754 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS41P49754 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS41P49754 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS41P49754 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS41P49754 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS41P49754 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS41P49754 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS41P49754 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS41P49754 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS41P49754 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS41P49754 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms