Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms