Protein–RNA interactions for Protein: P48775

TDO2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDO2P48775 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TDO2P48775 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TDO2P48775 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TDO2P48775 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TDO2P48775 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TDO2P48775 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TDO2P48775 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TDO2P48775 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TDO2P48775 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TDO2P48775 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TDO2P48775 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TDO2P48775 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TDO2P48775 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TDO2P48775 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TDO2P48775 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TDO2P48775 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TDO2P48775 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TDO2P48775 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TDO2P48775 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TDO2P48775 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TDO2P48775 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TDO2P48775 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TDO2P48775 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TDO2P48775 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TDO2P48775 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TDO2P48775 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TDO2P48775 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TDO2P48775 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TDO2P48775 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TDO2P48775 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TDO2P48775 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TDO2P48775 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TDO2P48775 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TDO2P48775 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TDO2P48775 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TDO2P48775 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TDO2P48775 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TDO2P48775 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TDO2P48775 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TDO2P48775 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TDO2P48775 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TDO2P48775 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TDO2P48775 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TDO2P48775 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TDO2P48775 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TDO2P48775 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TDO2P48775 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TDO2P48775 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TDO2P48775 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TDO2P48775 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TDO2P48775 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TDO2P48775 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TDO2P48775 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TDO2P48775 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TDO2P48775 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TDO2P48775 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TDO2P48775 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TDO2P48775 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TDO2P48775 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TDO2P48775 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TDO2P48775 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TDO2P48775 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TDO2P48775 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TDO2P48775 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TDO2P48775 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TDO2P48775 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TDO2P48775 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TDO2P48775 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TDO2P48775 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TDO2P48775 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TDO2P48775 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TDO2P48775 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TDO2P48775 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TDO2P48775 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDO2P48775 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDO2P48775 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDO2P48775 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDO2P48775 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDO2P48775 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDO2P48775 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDO2P48775 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDO2P48775 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TDO2P48775 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDO2P48775 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDO2P48775 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDO2P48775 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDO2P48775 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TDO2P48775 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDO2P48775 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDO2P48775 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDO2P48775 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDO2P48775 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDO2P48775 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDO2P48775 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDO2P48775 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDO2P48775 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDO2P48775 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDO2P48775 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDO2P48775 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDO2P48775 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms