Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1DP48730 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms