Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCLMP48507 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCLMP48507 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCLMP48507 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCLMP48507 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCLMP48507 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCLMP48507 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCLMP48507 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCLMP48507 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCLMP48507 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCLMP48507 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCLMP48507 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCLMP48507 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCLMP48507 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCLMP48507 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCLMP48507 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCLMP48507 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCLMP48507 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCLMP48507 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCLMP48507 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCLMP48507 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCLMP48507 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCLMP48507 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCLMP48507 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCLMP48507 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCLMP48507 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCLMP48507 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCLMP48507 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCLMP48507 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLMP48507 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLMP48507 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLMP48507 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLMP48507 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLMP48507 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLMP48507 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLMP48507 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLMP48507 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLMP48507 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLMP48507 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLMP48507 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLMP48507 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLMP48507 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLMP48507 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCLMP48507 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCLMP48507 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCLMP48507 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GCLMP48507 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCLMP48507 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCLMP48507 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCLMP48507 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
GCLMP48507 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLMP48507 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLMP48507 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLMP48507 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLMP48507 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLMP48507 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLMP48507 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLMP48507 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLMP48507 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLMP48507 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLMP48507 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLMP48507 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLMP48507 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLMP48507 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLMP48507 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLMP48507 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLMP48507 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCLMP48507 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCLMP48507 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCLMP48507 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCLMP48507 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCLMP48507 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCLMP48507 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCLMP48507 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCLMP48507 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCLMP48507 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCLMP48507 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLMP48507 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLMP48507 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLMP48507 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLMP48507 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLMP48507 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLMP48507 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLMP48507 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLMP48507 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLMP48507 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLMP48507 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLMP48507 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLMP48507 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLMP48507 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLMP48507 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLMP48507 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLMP48507 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCLMP48507 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCLMP48507 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCLMP48507 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCLMP48507 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCLMP48507 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCLMP48507 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCLMP48507 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.6 ms