Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL29P47914 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL29P47914 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL29P47914 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL29P47914 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL29P47914 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL29P47914 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL29P47914 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL29P47914 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL29P47914 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL29P47914 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL29P47914 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL29P47914 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL29P47914 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL29P47914 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL29P47914 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL29P47914 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL29P47914 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL29P47914 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL29P47914 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL29P47914 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL29P47914 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL29P47914 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL29P47914 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL29P47914 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL29P47914 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL29P47914 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL29P47914 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL29P47914 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL29P47914 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL29P47914 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL29P47914 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL29P47914 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL29P47914 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL29P47914 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL29P47914 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL29P47914 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL29P47914 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL29P47914 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL29P47914 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL29P47914 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL29P47914 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL29P47914 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL29P47914 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL29P47914 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL29P47914 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL29P47914 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL29P47914 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL29P47914 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL29P47914 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL29P47914 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL29P47914 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL29P47914 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL29P47914 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL29P47914 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL29P47914 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL29P47914 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL29P47914 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL29P47914 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL29P47914 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL29P47914 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL29P47914 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL29P47914 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL29P47914 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL29P47914 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL29P47914 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL29P47914 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL29P47914 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL29P47914 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL29P47914 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL29P47914 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL29P47914 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL29P47914 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL29P47914 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL29P47914 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL29P47914 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL29P47914 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL29P47914 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL29P47914 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL29P47914 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL29P47914 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL29P47914 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL29P47914 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL29P47914 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL29P47914 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL29P47914 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL29P47914 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL29P47914 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL29P47914 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL29P47914 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL29P47914 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL29P47914 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL29P47914 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL29P47914 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL29P47914 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL29P47914 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL29P47914 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL29P47914 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL29P47914 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL29P47914 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms