Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RANGAP1P46060 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms