Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA4P43681 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms