Protein–RNA interactions for Protein: P43405

SYK, Tyrosine-protein kinase SYK, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYKP43405 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYKP43405 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SYKP43405 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYKP43405 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYKP43405 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYKP43405 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYKP43405 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYKP43405 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYKP43405 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYKP43405 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYKP43405 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SYKP43405 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYKP43405 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYKP43405 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYKP43405 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYKP43405 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYKP43405 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYKP43405 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYKP43405 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYKP43405 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYKP43405 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYKP43405 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYKP43405 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SYKP43405 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SYKP43405 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYKP43405 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SYKP43405 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYKP43405 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYKP43405 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYKP43405 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYKP43405 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYKP43405 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYKP43405 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYKP43405 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYKP43405 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYKP43405 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYKP43405 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYKP43405 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYKP43405 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYKP43405 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYKP43405 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYKP43405 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYKP43405 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYKP43405 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYKP43405 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYKP43405 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYKP43405 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYKP43405 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYKP43405 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYKP43405 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SYKP43405 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYKP43405 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYKP43405 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYKP43405 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYKP43405 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYKP43405 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYKP43405 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYKP43405 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYKP43405 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYKP43405 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYKP43405 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYKP43405 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYKP43405 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYKP43405 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYKP43405 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYKP43405 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYKP43405 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYKP43405 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYKP43405 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYKP43405 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYKP43405 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYKP43405 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYKP43405 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYKP43405 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYKP43405 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYKP43405 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYKP43405 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYKP43405 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYKP43405 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYKP43405 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYKP43405 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYKP43405 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYKP43405 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYKP43405 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYKP43405 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYKP43405 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYKP43405 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYKP43405 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYKP43405 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYKP43405 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYKP43405 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYKP43405 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYKP43405 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYKP43405 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYKP43405 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYKP43405 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYKP43405 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYKP43405 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYKP43405 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYKP43405 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms