Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGER3P43115 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms