Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF5P43026 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF5P43026 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GDF5P43026 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF5P43026 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF5P43026 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GDF5P43026 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF5P43026 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF5P43026 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF5P43026 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF5P43026 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF5P43026 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF5P43026 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF5P43026 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF5P43026 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF5P43026 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF5P43026 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF5P43026 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF5P43026 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF5P43026 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF5P43026 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF5P43026 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF5P43026 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF5P43026 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF5P43026 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF5P43026 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF5P43026 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF5P43026 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF5P43026 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF5P43026 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF5P43026 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF5P43026 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF5P43026 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF5P43026 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF5P43026 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF5P43026 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF5P43026 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF5P43026 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF5P43026 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF5P43026 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF5P43026 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF5P43026 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF5P43026 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF5P43026 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF5P43026 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF5P43026 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF5P43026 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF5P43026 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF5P43026 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF5P43026 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GDF5P43026 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDF5P43026 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDF5P43026 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDF5P43026 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDF5P43026 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDF5P43026 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDF5P43026 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDF5P43026 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDF5P43026 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDF5P43026 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF5P43026 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF5P43026 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF5P43026 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF5P43026 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF5P43026 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF5P43026 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF5P43026 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF5P43026 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDF5P43026 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDF5P43026 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDF5P43026 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDF5P43026 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GDF5P43026 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDF5P43026 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GDF5P43026 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDF5P43026 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDF5P43026 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDF5P43026 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF5P43026 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF5P43026 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF5P43026 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF5P43026 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF5P43026 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF5P43026 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF5P43026 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF5P43026 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF5P43026 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF5P43026 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF5P43026 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF5P43026 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF5P43026 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF5P43026 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF5P43026 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDF5P43026 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF5P43026 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF5P43026 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF5P43026 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF5P43026 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF5P43026 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF5P43026 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms