Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGDSP41222 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDSP41222 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms