Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARL4AP40617 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms