Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 REI1YBR267W 1182 nt4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 GAD1YMR250W 1758 nt4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 RFT1YBL020W 1725 nt4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 ALD3YMR169C 1521 nt4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 ALD2YMR170C 1521 nt4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 RNA15YGL044C 891 nt4.81□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 URE2YNL229C 1065 nt4.81□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 RGS2YOR107W 930 nt4.81□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 TIF5YPR041W 1218 nt4.81□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 RTC1YOL138C 4026 nt4.81□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 GAL4YPL248C 2646 nt4.81□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 UBP7YIL156W 3216 nt4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 LCB2YDR062W 1686 nt4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 DBR1YKL149C 1218 nt4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 YGP1YNL160W 1065 nt4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 POP4YBR257W 840 nt4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 NOP58YOR310C 1536 nt4.79□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 YHR140WYHR140W 720 nt4.79□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 SPS19YNL202W 879 nt4.79□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 YPR071WYPR071W 636 nt4.79□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 PEP5YMR231W 3090 nt4.79□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 RAD16YBR114W 2373 nt4.79□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 CYM1YDR430C 2970 nt4.79□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 ATR1YML116W 1629 nt4.79□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 COX18YGR062C 951 nt4.78□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 YNL057WYNL057W 333 nt4.78□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 MVD1YNR043W 1191 nt4.78□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 CIN5YOR028C 888 nt4.78□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 YEH2YLR020C 1617 nt4.78□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 HOYDL227C 1761 nt4.78□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 VHC1YBR235W 3363 nt4.78□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 PCA1YBR295W 3651 nt4.77□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 AI5_BETAQ0075 1065 nt4.77□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 CIA2YHR122W 696 nt4.77□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt4.77□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 YNL217WYNL217W 981 nt4.77□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 SUA7YPR086W 1038 nt4.77□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 MET3YJR010W 1536 nt4.77□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 MSE1YOL033W 1611 nt4.76□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 CDC10YCR002C 969 nt4.76□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 YDR056CYDR056C 618 nt4.76□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 CNL1YDR357C 369 nt4.76□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 ERG4YGL012W 1422 nt4.76□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 YGR016WYGR016W 573 nt4.76□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 HPM1YIL110W 1134 nt4.76□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 YNK1YKL067W 462 nt4.76□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 YNL228WYNL228W 777 nt4.76□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 FRE7YOL152W 1863 nt4.76□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 ECM23YPL021W 564 nt4.76□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 YCR023CYCR023C 1836 nt4.76□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 FRE1YLR214W 2061 nt4.76□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 MOT2YER068W 1764 nt4.76□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.75□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 RPN6YDL097C 1305 nt4.75□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 PEX30YLR324W 1572 nt4.75□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 BUD13YGL174W 801 nt4.75□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 ALG2YGL065C 1512 nt4.75□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 YMR221CYMR221C 1515 nt4.75□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 ABF1YKL112W 2196 nt4.74□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 PRP40YKL012W 1752 nt4.74□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 LYS5YGL154C 819 nt4.74□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 PCL1YNL289W 840 nt4.74□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 TFG1YGR186W 2208 nt4.74□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 CBP1YJL209W 1965 nt4.74□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 DPH6YLR143W 2058 nt4.73□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 HST4YDR191W 1113 nt4.73□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 RPL34AYER056C-A 366 nt4.73□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 PXR1YGR280C 816 nt4.73□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 PMT5YDL093W 2232 nt4.73□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 BLM10YFL007W 6432 nt4.73□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 RPG1YBR079C 2895 nt4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 XKS1YGR194C 1803 nt4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 LEU1YGL009C 2340 nt4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 SUR2YDR297W 1050 nt4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 YER145C-AYER145C-A 438 nt4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 YIL165CYIL165C 360 nt4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 LOH1YJL038C 660 nt4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 ACP1YKL192C 378 nt4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 NTR2YKR022C 969 nt4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 UBI4YLL039C 1146 nt4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 YAR030CYAR030C 342 nt4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 NMD4YLR363C 657 nt4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 CEG1YGL130W 1380 nt4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 YPS7YDR349C 1791 nt4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 SSH4YKL124W 1740 nt4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 RAD52YML032C 1416 nt4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P40486 MKS1YNL076W 1755 nt4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 YHR214WYHR214W 612 nt4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 YAR066WYAR066W 612 nt4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 MTF1YMR228W 1026 nt4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 RMI1YPL024W 726 nt4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 ICY2YPL250C 411 nt4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 YBR139WYBR139W 1527 nt4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 VBA2YBR293W 1425 nt4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 HMLALPHA1YCL066W 528 nt4.7□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 MATALPHA1YCR040W 528 nt4.7□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 OCA4YCR095C 1089 nt4.7□□□□□ -1.66
SHQ1P40486 RXT3YDL076C 885 nt4.7□□□□□ -1.66
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