Protein–RNA interactions for Protein: P40305

IFI27, Interferon alpha-inducible protein 27, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27P40305 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFI27P40305 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFI27P40305 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFI27P40305 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFI27P40305 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFI27P40305 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFI27P40305 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFI27P40305 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFI27P40305 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFI27P40305 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFI27P40305 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFI27P40305 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFI27P40305 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFI27P40305 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFI27P40305 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFI27P40305 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFI27P40305 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFI27P40305 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFI27P40305 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFI27P40305 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFI27P40305 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFI27P40305 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFI27P40305 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFI27P40305 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFI27P40305 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFI27P40305 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFI27P40305 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFI27P40305 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFI27P40305 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFI27P40305 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFI27P40305 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFI27P40305 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFI27P40305 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFI27P40305 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFI27P40305 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFI27P40305 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFI27P40305 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFI27P40305 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFI27P40305 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFI27P40305 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFI27P40305 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFI27P40305 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFI27P40305 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFI27P40305 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFI27P40305 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFI27P40305 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFI27P40305 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFI27P40305 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFI27P40305 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFI27P40305 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFI27P40305 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFI27P40305 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFI27P40305 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFI27P40305 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFI27P40305 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFI27P40305 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFI27P40305 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFI27P40305 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFI27P40305 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IFI27P40305 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFI27P40305 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IFI27P40305 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFI27P40305 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFI27P40305 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IFI27P40305 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFI27P40305 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFI27P40305 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFI27P40305 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFI27P40305 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFI27P40305 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFI27P40305 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFI27P40305 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFI27P40305 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFI27P40305 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFI27P40305 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFI27P40305 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFI27P40305 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFI27P40305 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFI27P40305 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFI27P40305 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFI27P40305 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFI27P40305 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFI27P40305 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFI27P40305 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFI27P40305 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFI27P40305 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFI27P40305 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
IFI27P40305 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFI27P40305 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFI27P40305 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFI27P40305 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFI27P40305 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFI27P40305 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFI27P40305 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFI27P40305 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFI27P40305 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFI27P40305 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFI27P40305 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFI27P40305 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFI27P40305 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms