Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FDFT1P37268 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms