Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FLT4P35916 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FLT4P35916 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
FLT4P35916 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FLT4P35916 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FLT4P35916 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FLT4P35916 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FLT4P35916 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
FLT4P35916 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FLT4P35916 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FLT4P35916 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FLT4P35916 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
FLT4P35916 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FLT4P35916 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FLT4P35916 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FLT4P35916 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FLT4P35916 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FLT4P35916 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FLT4P35916 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FLT4P35916 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
FLT4P35916 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FLT4P35916 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FLT4P35916 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FLT4P35916 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FLT4P35916 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FLT4P35916 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FLT4P35916 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FLT4P35916 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
FLT4P35916 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
FLT4P35916 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FLT4P35916 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FLT4P35916 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FLT4P35916 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FLT4P35916 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FLT4P35916 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FLT4P35916 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FLT4P35916 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FLT4P35916 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FLT4P35916 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FLT4P35916 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FLT4P35916 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
FLT4P35916 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FLT4P35916 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FLT4P35916 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FLT4P35916 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FLT4P35916 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FLT4P35916 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FLT4P35916 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FLT4P35916 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FLT4P35916 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FLT4P35916 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FLT4P35916 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FLT4P35916 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FLT4P35916 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FLT4P35916 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FLT4P35916 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FLT4P35916 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
FLT4P35916 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FLT4P35916 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FLT4P35916 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
FLT4P35916 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FLT4P35916 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FLT4P35916 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FLT4P35916 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FLT4P35916 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FLT4P35916 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FLT4P35916 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FLT4P35916 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FLT4P35916 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FLT4P35916 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
FLT4P35916 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
FLT4P35916 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
FLT4P35916 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
FLT4P35916 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FLT4P35916 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
FLT4P35916 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FLT4P35916 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FLT4P35916 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
FLT4P35916 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FLT4P35916 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FLT4P35916 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FLT4P35916 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FLT4P35916 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FLT4P35916 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FLT4P35916 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FLT4P35916 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FLT4P35916 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
FLT4P35916 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FLT4P35916 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FLT4P35916 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FLT4P35916 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FLT4P35916 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FLT4P35916 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FLT4P35916 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FLT4P35916 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FLT4P35916 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FLT4P35916 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FLT4P35916 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FLT4P35916 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FLT4P35916 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms