Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC1P35052 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC1P35052 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC1P35052 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC1P35052 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC1P35052 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC1P35052 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC1P35052 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC1P35052 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC1P35052 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC1P35052 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC1P35052 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC1P35052 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC1P35052 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC1P35052 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC1P35052 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC1P35052 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC1P35052 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC1P35052 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC1P35052 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC1P35052 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC1P35052 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC1P35052 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC1P35052 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC1P35052 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC1P35052 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC1P35052 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC1P35052 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC1P35052 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC1P35052 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC1P35052 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC1P35052 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC1P35052 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC1P35052 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC1P35052 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GPC1P35052 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GPC1P35052 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPC1P35052 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPC1P35052 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPC1P35052 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPC1P35052 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPC1P35052 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPC1P35052 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPC1P35052 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPC1P35052 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPC1P35052 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GPC1P35052 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GPC1P35052 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPC1P35052 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPC1P35052 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPC1P35052 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPC1P35052 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPC1P35052 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPC1P35052 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPC1P35052 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPC1P35052 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPC1P35052 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPC1P35052 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPC1P35052 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GPC1P35052 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPC1P35052 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPC1P35052 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GPC1P35052 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GPC1P35052 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GPC1P35052 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GPC1P35052 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPC1P35052 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPC1P35052 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPC1P35052 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GPC1P35052 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GPC1P35052 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPC1P35052 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPC1P35052 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GPC1P35052 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPC1P35052 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPC1P35052 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC1P35052 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC1P35052 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPC1P35052 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC1P35052 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC1P35052 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPC1P35052 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC1P35052 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPC1P35052 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC1P35052 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GPC1P35052 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC1P35052 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPC1P35052 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC1P35052 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPC1P35052 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC1P35052 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPC1P35052 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPC1P35052 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPC1P35052 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPC1P35052 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPC1P35052 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPC1P35052 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPC1P35052 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPC1P35052 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPC1P35052 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms