Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms