Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EPHB2P29323 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPHB2P29323 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms