Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHATP28329 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHATP28329 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHATP28329 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHATP28329 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHATP28329 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHATP28329 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHATP28329 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHATP28329 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHATP28329 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHATP28329 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHATP28329 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHATP28329 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHATP28329 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHATP28329 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHATP28329 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHATP28329 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHATP28329 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHATP28329 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHATP28329 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHATP28329 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHATP28329 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHATP28329 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHATP28329 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHATP28329 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHATP28329 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHATP28329 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHATP28329 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHATP28329 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHATP28329 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHATP28329 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHATP28329 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHATP28329 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHATP28329 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHATP28329 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHATP28329 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHATP28329 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHATP28329 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHATP28329 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHATP28329 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHATP28329 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHATP28329 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHATP28329 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHATP28329 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHATP28329 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHATP28329 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHATP28329 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHATP28329 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHATP28329 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHATP28329 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHATP28329 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHATP28329 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHATP28329 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHATP28329 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHATP28329 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHATP28329 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHATP28329 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHATP28329 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHATP28329 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHATP28329 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHATP28329 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHATP28329 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHATP28329 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHATP28329 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHATP28329 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHATP28329 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHATP28329 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHATP28329 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHATP28329 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHATP28329 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHATP28329 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHATP28329 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHATP28329 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHATP28329 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHATP28329 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHATP28329 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHATP28329 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHATP28329 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHATP28329 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHATP28329 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHATP28329 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHATP28329 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHATP28329 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHATP28329 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHATP28329 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHATP28329 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHATP28329 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHATP28329 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHATP28329 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHATP28329 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHATP28329 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHATP28329 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHATP28329 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHATP28329 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHATP28329 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHATP28329 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHATP28329 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHATP28329 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHATP28329 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHATP28329 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms