Protein–RNA interactions for Protein: P25940

COL5A3, Collagen alpha-3(V) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A3P25940 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL5A3P25940 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL5A3P25940 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
COL5A3P25940 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
COL5A3P25940 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms