Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA4P25789 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms