Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSSP25774 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSSP25774 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSSP25774 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSSP25774 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSSP25774 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSSP25774 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSSP25774 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSSP25774 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSSP25774 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSSP25774 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSSP25774 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSSP25774 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSSP25774 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSSP25774 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSSP25774 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSSP25774 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSSP25774 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSSP25774 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSSP25774 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSSP25774 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSSP25774 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSSP25774 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSSP25774 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSSP25774 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSSP25774 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSSP25774 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSSP25774 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSSP25774 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSSP25774 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSSP25774 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSSP25774 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSSP25774 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CTSSP25774 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSSP25774 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSSP25774 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSSP25774 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSSP25774 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSSP25774 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSSP25774 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSSP25774 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSSP25774 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSSP25774 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSSP25774 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSSP25774 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSSP25774 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSSP25774 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSSP25774 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSSP25774 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSSP25774 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSSP25774 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSSP25774 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSSP25774 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSSP25774 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSSP25774 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSSP25774 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSSP25774 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSSP25774 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSSP25774 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSSP25774 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSSP25774 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSSP25774 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSSP25774 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSSP25774 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSSP25774 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSSP25774 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSSP25774 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSSP25774 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSSP25774 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSSP25774 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSSP25774 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSSP25774 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSSP25774 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSSP25774 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSSP25774 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSSP25774 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSSP25774 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSSP25774 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSSP25774 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSSP25774 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSSP25774 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSSP25774 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSSP25774 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSSP25774 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSSP25774 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSSP25774 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSSP25774 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSSP25774 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSSP25774 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSSP25774 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSSP25774 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSSP25774 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSSP25774 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSSP25774 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSSP25774 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSSP25774 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSSP25774 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSSP25774 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSSP25774 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSSP25774 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms