Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GADD45AP24522 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms