Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAMP1P23763 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms