Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAX3P23760 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAX3P23760 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAX3P23760 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAX3P23760 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAX3P23760 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAX3P23760 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAX3P23760 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PAX3P23760 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAX3P23760 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAX3P23760 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAX3P23760 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAX3P23760 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAX3P23760 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAX3P23760 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAX3P23760 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAX3P23760 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAX3P23760 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAX3P23760 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAX3P23760 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAX3P23760 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAX3P23760 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PAX3P23760 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAX3P23760 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAX3P23760 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAX3P23760 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAX3P23760 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAX3P23760 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAX3P23760 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAX3P23760 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAX3P23760 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAX3P23760 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAX3P23760 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAX3P23760 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PAX3P23760 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAX3P23760 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAX3P23760 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAX3P23760 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAX3P23760 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAX3P23760 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAX3P23760 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PAX3P23760 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAX3P23760 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAX3P23760 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PAX3P23760 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAX3P23760 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAX3P23760 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAX3P23760 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PAX3P23760 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAX3P23760 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAX3P23760 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAX3P23760 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAX3P23760 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAX3P23760 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAX3P23760 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAX3P23760 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAX3P23760 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAX3P23760 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAX3P23760 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAX3P23760 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAX3P23760 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAX3P23760 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAX3P23760 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PAX3P23760 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PAX3P23760 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PAX3P23760 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAX3P23760 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAX3P23760 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAX3P23760 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAX3P23760 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAX3P23760 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAX3P23760 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAX3P23760 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAX3P23760 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAX3P23760 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAX3P23760 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAX3P23760 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAX3P23760 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAX3P23760 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAX3P23760 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAX3P23760 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAX3P23760 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAX3P23760 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAX3P23760 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAX3P23760 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAX3P23760 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAX3P23760 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAX3P23760 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAX3P23760 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAX3P23760 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PAX3P23760 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAX3P23760 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAX3P23760 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAX3P23760 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PAX3P23760 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAX3P23760 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PAX3P23760 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAX3P23760 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAX3P23760 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAX3P23760 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms